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Physics Laboratory 1 - biosistemi
Orario delle Lezioni (prima lezione: mercoledi 27 Settembre 2023 ore 12.00)
Mercoledi 12.00-14.00 (connettersi/essere in aula alle 12.00, inizio lezione alle 12.15)
Aula Rasetti (Edificio Marconi - CU013 - secondo piano)
Giovedi 10.00-12.00 (connettersi/essere in aula alle 10.00, inizio lezione alle 10.15)
Aula 7 (Edificio Fermi - CU033 - quarto piano)
Iscrizione a Google Classroom consigliata, codice: 5yljrns
Calendario delle lezioni con argomenti giorno per giorno: https://calendar.google.com/calendar/u/1?cid=bDdwZXMwcnQyNjR0M2dvOHYzamJwdGFxcjRAZ3JvdXAuY2FsZW5kYXIuZ29vZ2xlLmNvbQ
Modalità di esame e date: discussione di alcune delle slides presentate in aula, la lista di tutte le slides da conoscere per superare l'esame è disponibile qui: https://drive.google.com/file/d/10fA88KQ8RJcA96vg894---TSr9ZRCNJk/view?usp=sharing
Ricevimento nel mio studio su appuntamento: stanza 405, corridoio 4 piano, edificio Fermi
Programma del corso di Physics Laboratory I (curriculum Bio) (ENGLISH VERSION BELOW)
1. Introduzione: Interazione radiazione-materia (testo: F. Wooten, "Optical Properties of Solids", pdf available below)
2. Tecniche di imaging per la biofisica:
- Microscopia ottica, limite di diffrazione e super-risoluzione
(testo: Resolution Ehancement Techniques, pdf available below)
- Microscopia in fluorescenza
http://toutestquantique.fr/en/fluorescent-and-confocal/
https://en.wikipedia.org/wiki/Fluorescence
https://en.wikipedia.org/wiki/Franck–Condon_principle
- Microscopia elettronica (SEM, TEM)
http://toutestquantique.fr/en/scanning-electron/
http://toutestquantique.fr/en/transmission-electron/
https://en.wikipedia.org/wiki/Transmission_electron_microscopy
https://en.wikipedia.org/wiki/Scanning_electron_microscope
https://www.niaid.nih.gov/news-events/novel-coronavirus-sarscov2-images
- Microscopia a forza atomica (AFM)
http://toutestquantique.fr/en/afm/
https://en.wikipedia.org/wiki/Atomic_force_microscopy
- Microscopia in campo vicino (SNOM)
http://toutestquantique.fr/en/laser/
https://en.wikipedia.org/wiki/Near-field_scanning_optical_microscope
3. Tecniche strutturali per la biofisica:
- Diffrazione a raggi X (cristallografia di proteine)
- Spettroscopia vibrazionale (IR and Raman)
testo: slides del docente, pdf available below
- Microscopia elettronica in trasmissione criogenica (Cryo-TEM)
https://en.wikipedia.org/wiki/Transmission_electron_cryomicroscopy
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4131193/
4. Tecniche diagnostiche e funzionali basate su principi fisici avanzati:
- amplificazione genica (PCR)
https://en.wikipedia.org/wiki/DNA_sequencing#High-throughput_sequencing_(HTS)_methods
- immunofluorescenza
https://en.wikipedia.org/wiki/Immunofluorescence
https://en.wikipedia.org/wiki/Franck%E2%80%93Condon_principle
- sensori a plasmone di superficie (SPR)
testo: Enhanced spectroscopies (pdf available below)
ENGLISH
1. Introduction: Light-matter interaction
2. Imaging techniques in biophysics:
- Optical Microscopy, Diffraction limit, Super-resolution
- Fluorescence Microscopy
- Electron Microscopy (SEM)
- Atomic Force Microscopy (AFM)
- Near-field Microscopy (SNOM)
3. Structural techniques in biophysics:
- X-ray Diffraction (Protein crystallography)
- Vibrational Spectroscopy (IR and Raman)
- Cryogenic Electron Microscopy (Cryo-TEM)
4. Diagnostics and Functional Techniques based on advanced principles of physics :
- Gene amplification (PCR)
- Immunofluorescence
- Surface Plasmone Sensors (SPR)
if Drive does not work, then use this link to download the Textbooks:
https://drive.google.com/drive/folders/1ezIs1MxncWGhJqaQMhy9IZpA9EteUGEF?usp=sharing
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